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ADVANCES IN REFERENCE GENE VALIDATION FOR GENE EXPRESSION STUDIES IN CASSAVA (Manihot esculenta Crantz): AN OVERVIEW OF THE MAIN GENES AND STUDIED CONDITIONS

AN OVERVIEW OF THE MAIN GENES AND STUDIED CONDITIONS

Autores/as

DOI:

https://doi.org/10.20873/saberesemcirculacao3

Resumen

RESUMEN:

La reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real con transcripción inversa (RT-qPCR) se utiliza ampliamente en estudios de expresión génica, siendo esencial la selección adecuada de genes de referencia para garantizar la fiabilidad de los resultados. Este estudio analizó la literatura disponible con el fin de identificar los genes de referencia más comúnmente estudiados, seleccionados y validados en investigaciones de expresión génica en yuca (Manihot esculenta Crantz). A través de una revisión bibliográfica, se analizaron cinco publicaciones centradas en la selección y validación de genes de referencia en yuca. En total, se realizaron 55 evaluaciones de genes en los estudios analizados, considerando que algunos genes fueron investigados más de una vez. Los resultados indicaron que los genes PP2A, UBQ10, GTPb, EF1, TUB, TBP, NAC, HisD, 26S y ZFP se encuentran entre los más estables en los estudios seleccionados. Entre ellos, los genes PP2A y GTPb se destacaron como los más estables en tres y dos estudios, respectivamente. En contraste, genes ampliamente utilizados como ACT y GAPDH no fueron validados en ninguno de los estudios analizados al considerar todas las muestras de cada experimento. Los algoritmos geNorm y NormFinder fueron los más empleados para evaluar la estabilidad de los genes de referencia, mientras que RefFinder fue empleado en un solo estudio. Esta revisión resalta la importancia de la validación experimental específica para la yuca y sugiere que la adopción de múltiples herramientas de análisis puede mejorar la precisión y fiabilidad de los estudios de expresión génica.

Palabras clave: RT-qPCR, Normalización, Expresión Génica.

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Publicado

2025-12-19

Versiones

Cómo citar

Gomes de Oliveira, J. R., Pontes Araújo, I., Aparecida Ságio, S., Almeida Lima, A., & Barreto, H. G. (2025). ADVANCES IN REFERENCE GENE VALIDATION FOR GENE EXPRESSION STUDIES IN CASSAVA (Manihot esculenta Crantz): AN OVERVIEW OF THE MAIN GENES AND STUDIED CONDITIONS: AN OVERVIEW OF THE MAIN GENES AND STUDIED CONDITIONS. DESAFIOS, 12(7), 247–265. https://doi.org/10.20873/saberesemcirculacao3

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