ADVANCES IN REFERENCE GENE VALIDATION FOR GENE EXPRESSION STUDIES IN CASSAVA (Manihot esculenta Crantz):

AN OVERVIEW OF THE MAIN GENES AND STUDIED CONDITIONS

Autores

DOI:

https://doi.org/10.20873/saberesemcirculacao3

Resumo

RESUMO:

A técnica de reação em cadeia da polimerase em tempo real quantitativa, com transcrição reversa (RT-qPCR), é amplamente utilizada em estudos de expressão gênica, sendo essencial a seleção adequada de genes de referência para garantir a confiabilidade dos resultados. Este estudo analisou a literatura disponível para identificar os genes de referência mais comumente estudados, selecionados e validados em pesquisas de expressão gênica em mandioca (Manihot esculenta Crantz). Por meio de um levantamento bibliográfico, foram analisadas cinco publicações sobre seleção e validação de genes de referência em mandioca. Um total de 55 avaliações de genes foi realizado nos estudos analisados, considerando que alguns genes foram investigados mais de uma vez. Os resultados indicaram que os genes PP2A, UBQ10, GTPb, EF1, TUB, TBP, NAC, HisD, 26S e ZFP estão entre os mais estáveis nos estudos realizados. Dentre eles, destacam-se os genes PP2A e GTPb, que estão entre os mais estáveis em três e dois estudos, respectivamente. Em contraste, genes amplamente utilizados, como ACT e GAPDH, não foram validados em nenhum dos estudos analisados, ao analisar todas as amostras de cada experimento. Os algoritmos geNorm e NormFinder foram os mais utilizados para avaliar a estabilidade dos genes de referência, enquanto o RefFinder foi empregado em apenas um dos estudos. Esta revisão destaca a importância da validação experimental específica para a cultura da mandioca, além de sugerir que a adoção de múltiplas ferramentas de análise pode aumentar a precisão e a confiabilidade dos estudos de expressão gênica.

Palavras-chave: RT-qPCR, Normalização, Expressão Gênica.

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Publicado

2025-12-19 — Atualizado em 2025-12-19

Versões

Como Citar

Gomes de Oliveira, J. R., Pontes Araújo, I., Aparecida Ságio, S., Almeida Lima, A., & Barreto, H. G. (2025). ADVANCES IN REFERENCE GENE VALIDATION FOR GENE EXPRESSION STUDIES IN CASSAVA (Manihot esculenta Crantz):: AN OVERVIEW OF THE MAIN GENES AND STUDIED CONDITIONS. DESAFIOS - Revista Interdisciplinar Da Universidade Federal Do Tocantins, 12(7), 247–265. https://doi.org/10.20873/saberesemcirculacao3

Edição

v. 12 n. 7 (2025): Saberes em circulação

Seção

Artigos

Licença

Copyright (c) 2025 Jaderson Roney Gomes de Oliveira, Ivo Pontes Araújo, Solange Aparecida Ságio, André Almeida Lima, Horllys Gomes Barreto

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