Predicción fisicoquímicas, modelado y análisis mecanismo de interacción de la quitinasa Mo-chi1, un poli-β-(1-4)-N-acetil-D-glucosamina [Moringa oleifera, LAM.]: Un enfoque in silico

Autores/as

  • Lara Cristhian Costa Bezerra
  • Evaristo Wagner Alves de Queiroz
  • José Ednésio da Cruz Freire

DOI:

https://doi.org/10.20873/uft.2359-3652.2018vol5n1p111

Resumen

Las quitinasas son enzimas capaces de hidrolizar enlaces β-(1,4) entre residuos de N-acetil-β-D-glucosamina (GlcNAc), presentes en varios organismos. Conocer las propiedades fisicoquímicas de Mo-chi1 identificadas en la planta de Moringa oleifera utilizando herramientas in silico. Después de buscar en la base de datos del genoma chino de plantas herbales, se analizó la secuencia (ID: 10006495) para péptido señal, propiedades fisicoquímicas, puentes de sulfuro, dominios, estructuras secundarias, modelado. El modo de interacción entre Mo-chi1 y quitina se predijo con el programa AutoDock Vina. Mo-chi1 posee péptido señal con 19 aminoácidos de longitud (escindido: Ala19 e Ile20), formando un polipéptido maduro de 379 residuos. El maduro tiene Mr = 39.56 kDa, pI = 5.44, II = 35.61 y GRAVY = -0.135. Tiene un puente de sulfuro (5Cys-Cys398). Pertenecen a la familia GH18 con un valor E de 7.43e-153 (CDD) y 2.3e-90 (SMART). Tiene un predominio de β-sheet (16.85-37%), seguido de α-Helix (23.3-30.34%) y loops (39.5-52.81%). El estudio de acoplamiento molecular mostró energía favorable para la interacción entre Mo-chi1 y GlcNAc con un valor E = -5.9 kcal.mol-1. Aunque Mo-chi1 mostró propiedades fisicoquímicas similares a otras quitinasas GH18, se necesitan estudios más refinados para identificar su verdadero potencial.

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Publicado

2018-03-31

Cómo citar

Bezerra, L. C. C., Queiroz, E. W. A. de, & Freire, J. E. da C. (2018). Predicción fisicoquímicas, modelado y análisis mecanismo de interacción de la quitinasa Mo-chi1, un poli-β-(1-4)-N-acetil-D-glucosamina [Moringa oleifera, LAM.]: Un enfoque in silico. DESAFIOS, 5(1), 111–120. https://doi.org/10.20873/uft.2359-3652.2018vol5n1p111

Número

Vol. 5 Núm. 1 (2018)

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Artigos

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